Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp26Q99MX1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp26Q99MX1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms