Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms