Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms