Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms