Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms