Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms