Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rdh10Q8VCH7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms