Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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