Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms