Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc3Q8CFZ4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc3Q8CFZ4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc3Q8CFZ4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc3Q8CFZ4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc3Q8CFZ4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc3Q8CFZ4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms