Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms