Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Bcas3Q8CCN5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Bcas3Q8CCN5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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