Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms