Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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