Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm29444-201ENSMUST00000187152 1156 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mobp-201ENSMUST00000068698 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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