Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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