Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms