Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms