Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Msrb2Q78J03 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msrb2Q78J03 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms