Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms