Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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