Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Fndc3c1Q6DFV6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Fndc3c1Q6DFV6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Fndc3c1Q6DFV6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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