Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prex1Q69ZK0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prex1Q69ZK0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms