Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfe3Q64092 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfe3Q64092 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms