Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Defa17Q64016 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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