Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sall3Q62255 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms