Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Phox2aQ62066 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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