Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ecm1Q61508 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ecm1Q61508 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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