Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ccne1Q61457 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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