Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms