Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc5a6Q5U4D8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.8 ms