Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms