Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim58Q5NCC9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim58Q5NCC9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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