Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ankrd42Q3V096 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179 ms