Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbm44Q3V089 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbm44Q3V089 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms