Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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