Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms