Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms