Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LbrQ3U9G9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms