Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms