Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sec24aQ3U2P1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms