Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms