Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms