Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms