Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms