Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm1Q0GA42 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnnm1Q0GA42 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms