Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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