Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms