Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms