Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms